防止冷卻水系統結水垢，一般采用以下幾種方法：

（1）根據所選用的處理方案和濃縮倍數的要求，控制成垢物質進入冷卻水中的量，把補充水軟化到一定程度，控制水中鈣離子的含量；

（2）在循環水中加酸或二氧化碳低PH值，以控制碳酸根離子；

（3）使用阻垢劑破壞CACO3等鹽類的結晶增長過程，達到控制水垢形成的目的。

以上采用的都是化學處理方法。現在國內也有使用物理方法防止冷卻水系統結水垢。研制成的靜電水垢控制器，就是將冷卻水通過外加電壓3400V-6000V的靜電水處理裝置，在強的靜電場中，產生極化作用，阻止水中溶解鹽的陰陽離子產生化學結合，因而陰謀詭計結垢。