傳統的水處理器作為循環系統的一部分安裝在系統支管路或總管路上，皆采用全流式結構和全流式的處理方式，這種方式要求循環水通過水處理器，再進入工藝設備，也就是說水處理器的進出口與工藝系統管路通徑幾乎相同。如：工藝設備的過水量是200m3/h,那么水處理器的過水量也必須是200m3/h.因此全流式水處理器往往又笨重又龐大，安裝不便，維修時還要求將系統總管中的水排空，這就會影響循環系統的正常工作。
而旁流式水處理器只需旁流處理系統流量的1-3%，即旁流式水處理器的過水量為2～6m3/h,就可以達到處理目的了。